张旭东
张旭东

性别: 湖北 - 武汉 注册于 2019-11-01

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最近动态

2020-04-27 09:16 回答问题

每周集中开通一批,今天就开通。

2020-01-03 10:12 回答问题

要算相关性,表型必须是数值型的,不知道你的表型是什么,比如肿瘤的四个分期,可以用 1,2,3,4 表示

2020-01-03 10:10 回答问题

用了 corset,我记得他会生成一个 cluster.txt 的文件,里面记录了 cluster 与 transcript 的对应关系,相当于 gene_trans_map

2020-01-03 10:08 回答问题

GSE 编号是多少,我看下

2020-01-03 10:07 回答问题

包没安装好, 已经处理好了,再重新运行试试

2019-12-30 17:20 回答问题

构建网络的时候, maxBlockSize 设置大一些,大于你的基因数目 比如 100000

2019-12-25 14:19 发表了文章

2019-12-21 18:03 回答问题

把 DEP_15vs0 打印出来看下,估计有问题

2019-12-21 17:56 回答问题

cyt <- exportNetworkToCytoscape( m_TOM, edgeFile = "output/CytoscapeInput-edges.txt", nodeFile = "output/CytoscapeInput-nodes.txt", weighted = TRUE, threshold = 0.3, nodeNames = m_wgcna_result$probe, altNodeNames = m_wgcna_result$Gene_S

2019-12-21 17:55 回答问题

pData 函数的输入文件是一个 ExpressionSet,你那个 GSE119014_expression 估计不是吧