R 读取 gtf 文件

R 读取 gtf 文件,可以使用基础的方法或者 readr 来完成,但是比较麻烦

refGenome 包中的 read.gtf 用起来比较方便

library(refGenome)

# 创建一个 ensemblGenome 对象
ens <- ensemblGenome()

# 将 gtf 读取到 ens
read.gtf(ens, 'genome.gtf')

# 将 ens 转换为一个 data frame
gtf_df  <- getGtf(ens)
  • 发表于 2019-11-13 14:57
  • 阅读 ( 51 )

你可能感兴趣的文章

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
张旭东
张旭东

3 篇文章

作家榜 »

  1. 张旭东 3 文章
  2. 余胜 1 文章
  3. 李国成 0 文章
  4. zsqh 0 文章
  5. Haixia Wang 0 文章
  6. 任静 0 文章
  7. 葛键 0 文章
  8. Hui 0 文章