R 读取 gtf 文件

R 读取 gtf 文件,可以使用基础的方法或者 readr 来完成,但是比较麻烦

refGenome 包中的 read.gtf 用起来比较方便

library(refGenome)

# 创建一个 ensemblGenome 对象
ens <- ensemblGenome()

# 将 gtf 读取到 ens
read.gtf(ens, 'genome.gtf')

# 将 ens 转换为一个 data frame
gtf_df  <- getGtf(ens)
  • 发表于 2019-11-13 14:57
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张旭东
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